Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT23-202ENST00000436344 1485 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 FO393411.1-201ENST00000325612 420 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 IL36G-202ENST00000376489 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 OLA1P1-201ENST00000396387 1189 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL12P19-201ENST00000429825 486 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS3AP29-201ENST00000437728 769 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 LIF-AS1-201ENST00000447565 808 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NUTF2P5-201ENST00000475013 379 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RN7SL687P-201ENST00000480496 285 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ENPP7P10-201ENST00000504828 933 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 C5orf58-202ENST00000517575 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC087521.3-201ENST00000528226 553 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC138907.7-202ENST00000565347 540 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC141257.2-201ENST00000569199 540 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC087393.2-201ENST00000580962 504 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC239859.6-201ENST00000622095 213 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC016877.1-201ENST00000420417 464 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC098617.1-202ENST00000428980 1207 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC104695.1-201ENST00000439700 849 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC118653.1-201ENST00000442627 561 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AL139237.1-201ENST00000446107 513 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC002463.1-201ENST00000453459 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC108039.1-201ENST00000456719 609 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 PPM1K-204ENST00000508256 923 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 SDHC-208ENST00000513009 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 HTATIP2-206ENST00000531058 1060 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC048344.2-201ENST00000547280 147 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC027808.2-203ENST00000558261 638 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC015818.5-201ENST00000578659 356 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR4314-201ENST00000583321 92 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC021382.2-201ENST00000584547 922 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF257-207ENST00000600162 817 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AL034428.1-202ENST00000613736 625 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGOHB-211ENST00000625272 319 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CCNB1IP1Q9NPC3 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms