Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 DKK2-202ENST00000510463 908 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LINC01778-208ENST00000635288 1095 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MAPK10-290ENST00000641237 2826 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TBX22-202ENST00000373296 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ABCC11-203ENST00000394747 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MMP3-201ENST00000299855 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MYO1H-201ENST00000310903 4364 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC024257.1-201ENST00000547523 566 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC116348.2-201ENST00000563751 577 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CCRL2-204ENST00000400882 1642 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LINC00299-201ENST00000430192 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PUS3-201ENST00000227474 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR2M3-201ENST00000456743 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 IGHVIV-44-1-201ENST00000519334 338 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC099792.1-202ENST00000635290 2012 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 PLCH1-204ENST00000460012 6413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 FAM83F-201ENST00000333407 15561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SLC6A15-201ENST00000266682 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 UBTFL7-201ENST00000418789 1191 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AMMECR1-IT1-201ENST00000418848 561 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 UHRF2P1-201ENST00000431339 2387 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AP004833.1-201ENST00000507987 1238 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SCMH1-210ENST00000402904 3204 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 MSL3P1-201ENST00000438684 2032 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
POLR2AP24928 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms