Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms