Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms