Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPH3AQ9Y2J0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms