Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCAF8Q9UPN6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCAF8Q9UPN6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms