Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP18Q9UMW8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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