Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTH4Q9UIA0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH4Q9UIA0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms