Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms