Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
CC2D2AQ9P2K1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CC2D2AQ9P2K1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms