Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DNAJC28Q9NX36 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms