Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT57Q9NWB7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT57Q9NWB7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms