Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MBNL3Q9NUK0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MBNL3Q9NUK0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms