Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA4L2Q9NRX3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms