Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRPL17Q9NRX2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms