Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB6BQ9NRW1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms