Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH2B1Q9NRF2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH2B1Q9NRF2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms