Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DUOX1Q9NRD9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms