Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMG20AQ9NP66 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMG20AQ9NP66 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms