Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRKRIP1Q9H875 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKRIP1Q9H875 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms