Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCAS3Q9H6U6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms