Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL3Q9BXA9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL3Q9BXA9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms