Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms