Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KATNB1Q9BVA0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KATNB1Q9BVA0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms