Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms