Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNS3Q9BQ31 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms