Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VGLL1Q99990 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms