Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED1Q99966 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms