Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP9Q99956 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP9Q99956 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms