Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRQ99707 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms