Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EYA3Q99504 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EYA3Q99504 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms