Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms