Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA5Q96PV4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA5Q96PV4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms