Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OPALINQ96PE5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
OPALINQ96PE5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms