Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF4Q96M43 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NBPF4Q96M43 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms