Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
USP47Q96K76 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP47Q96K76 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms