Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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FAM46AQ96IP4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM46AQ96IP4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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