Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDC3Q96F86 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDC3Q96F86 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms