Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CMTM5Q96DZ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms