Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG4CQ96DT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms