Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM54Q969K7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms