Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFKQ969G6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms