Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGGTAQ92696 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms