Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAAF4Q8WXU2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms