Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC4Q8WW27 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms