Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC148Q8NFR7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms