Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RDH13Q8NBN7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms