Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD53Q8N9V6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms