Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNRD3Q86VQ6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNRD3Q86VQ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms