Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GDPD3Q7L5L3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GDPD3Q7L5L3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms